故事舞台设定在有严格等级制度，学生分为学生会长，学生会成员和亲卫队选民，以及平民三个等级的岚之丘学园，神秘转校生清水小百合却破坏了规矩，她不服从学生会，我行我素，与学生会发生冲突。

讲述安倍晴明学生时代的故事。在阴阳寮，被誉为天才的安倍晴明与其他学生截然不同，他是个有些讨人厌且对成为阴阳师毫无兴趣的怪人。　　有一天，晴明受到贵族源博雅的委托，解决袭击皇族徽子女王的怪异现象。尽管两人经常发生冲突，但他们还是一起追寻真相。而一名学生的离奇死亡成为事件火索火索，引发了卷入平安京的邪恶阴谋和诅咒的动乱。